More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4083 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
336 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  80.65 
 
 
336 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.6 
 
 
335 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.6 
 
 
332 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.76 
 
 
334 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.07 
 
 
334 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  60.98 
 
 
335 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.63 
 
 
326 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  58.31 
 
 
333 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.42 
 
 
326 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.82 
 
 
333 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.08 
 
 
334 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.7 
 
 
326 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.7 
 
 
326 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.57 
 
 
336 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.06 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.21 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.09 
 
 
323 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.05 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.85 
 
 
335 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 
328 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.68 
 
 
328 aa  355  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
330 aa  348  6e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  51.96 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  51.36 
 
 
323 aa  339  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.92 
 
 
327 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.82 
 
 
335 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
327 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
345 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
312 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
313 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
328 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
313 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.4 
 
 
330 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.51 
 
 
330 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
328 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.67 
 
 
318 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.02 
 
 
308 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
304 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
328 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  30.37 
 
 
308 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
324 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
325 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
306 aa  145  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
299 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
322 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
329 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.61 
 
 
336 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
335 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  32.62 
 
 
319 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.65 
 
 
338 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.84 
 
 
357 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.12 
 
 
310 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  30.37 
 
 
323 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.84 
 
 
312 aa  143  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.37 
 
 
318 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
317 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.29 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.84 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.27 
 
 
331 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
321 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.27 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.83 
 
 
331 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  32.94 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.94 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  31.71 
 
 
343 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
343 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
329 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
324 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.66 
 
 
307 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
311 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
322 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
332 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.56 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.45 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.02 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.64 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  28.97 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.14 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.93 
 
 
322 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  33.02 
 
 
345 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.72 
 
 
323 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.99 
 
 
335 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>