More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4201 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 334 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.58 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.23 
 
 		 317 aa  325  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  57.51 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.55 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  54.78 
 
 		 314 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.16 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.16 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.4 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.65 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.97 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  39.41 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 		 306 aa  232  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.81 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.83 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 		 313 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.63 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.42 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 		 312 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  36.27 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.01 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.71 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.01 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  35.44 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.69 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.18 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  37.03 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  37.13 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34177  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 684 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  33.02 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>