More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3080 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
333 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.21 
 
 
336 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
336 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.79 
 
 
343 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.27 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.3 
 
 
318 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.81 
 
 
330 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
346 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.65 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.15 
 
 
313 aa  318  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.35 
 
 
313 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.35 
 
 
313 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.49 
 
 
311 aa  318  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.82 
 
 
311 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.65 
 
 
322 aa  316  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
321 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.7 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.99 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.17 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.65 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.81 
 
 
315 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.65 
 
 
317 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.16 
 
 
330 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.33 
 
 
317 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.49 
 
 
313 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  51.14 
 
 
339 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.01 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.49 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.9 
 
 
340 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.9 
 
 
340 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 
311 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.65 
 
 
316 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.51 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  49.19 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.04 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  49.19 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.63 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.05 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  50 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  48.2 
 
 
311 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.87 
 
 
315 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
316 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.69 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.25 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  48.87 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.51 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.01 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.79 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.34 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.19 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
325 aa  301  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.85 
 
 
311 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.58 
 
 
324 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
308 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.22 
 
 
315 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
321 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.33 
 
 
326 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.84 
 
 
311 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
308 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.43 
 
 
333 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  49.5 
 
 
326 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.43 
 
 
333 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
329 aa  299  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
329 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.17 
 
 
326 aa  299  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.9 
 
 
350 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  47.56 
 
 
320 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
316 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.69 
 
 
331 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.71 
 
 
330 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.63 
 
 
356 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
346 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.91 
 
 
317 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 
343 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
327 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  47.87 
 
 
326 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 
346 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.05 
 
 
318 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.86 
 
 
336 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.54 
 
 
311 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
318 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.59 
 
 
319 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.03 
 
 
318 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.91 
 
 
311 aa  292  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.36 
 
 
322 aa  291  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.81 
 
 
329 aa  291  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  47.3 
 
 
337 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
335 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  47.3 
 
 
337 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.84 
 
 
319 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.34 
 
 
365 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
335 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.93 
 
 
315 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.22 
 
 
323 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 
311 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 
312 aa  289  6e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  47.19 
 
 
316 aa  289  6e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 
308 aa  288  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 
340 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0105803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>