More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0190 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.27 
 
 
346 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
346 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.23 
 
 
356 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.59 
 
 
365 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.94 
 
 
335 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.1 
 
 
340 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.62 
 
 
340 aa  447  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.28 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.8 
 
 
346 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.25 
 
 
337 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  61.92 
 
 
337 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.25 
 
 
337 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.96 
 
 
318 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.31 
 
 
348 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 
337 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0779716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 
336 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.02 
 
 
310 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.23 
 
 
346 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.33 
 
 
311 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.35 
 
 
351 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.151939  normal  0.0166428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.98 
 
 
348 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.54 
 
 
321 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.01 
 
 
318 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  58.39 
 
 
317 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.44 
 
 
319 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.55 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.63 
 
 
318 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.75 
 
 
337 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5321  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 
312 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.28 
 
 
308 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.87 
 
 
320 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.36 
 
 
343 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.7 
 
 
347 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.96 
 
 
335 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.69 
 
 
345 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
333 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
335 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.39 
 
 
316 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
311 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.88 
 
 
333 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 
311 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.59 
 
 
311 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.69 
 
 
345 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.27 
 
 
320 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.75 
 
 
311 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.74 
 
 
314 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.75 
 
 
313 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57 
 
 
313 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  58.36 
 
 
331 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  59.34 
 
 
325 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 
311 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.42 
 
 
315 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  58.63 
 
 
331 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.02 
 
 
317 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
315 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.95 
 
 
330 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.83 
 
 
313 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.65 
 
 
319 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.9 
 
 
312 aa  364  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 
324 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
340 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.33 
 
 
340 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.51 
 
 
313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.35 
 
 
311 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
333 aa  362  6e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.81 
 
 
345 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.02 
 
 
341 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.91 
 
 
318 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.96 
 
 
330 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.07 
 
 
326 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.39 
 
 
314 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.07 
 
 
340 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.39 
 
 
319 aa  359  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.07 
 
 
340 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 
313 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.89 
 
 
316 aa  355  5e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.7 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.09 
 
 
342 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.98 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.39 
 
 
308 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.39 
 
 
308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  52.24 
 
 
514 aa  352  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  57.19 
 
 
340 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 
315 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  57.19 
 
 
340 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.28 
 
 
309 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.1 
 
 
322 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.72 
 
 
316 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  54.75 
 
 
326 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.07 
 
 
318 aa  345  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 
311 aa  345  8.999999999999999e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.59 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.96 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  55.41 
 
 
350 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.26 
 
 
318 aa  341  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.82 
 
 
311 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.38 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.38 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.38 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>