More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1809 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
302 aa  618  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.08 
 
 
343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
336 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.69 
 
 
318 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 
313 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 
318 aa  263  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.76 
 
 
311 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.63 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
316 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
311 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
311 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
314 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.48 
 
 
337 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.48 
 
 
337 aa  255  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
335 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 
311 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 
316 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.32 
 
 
308 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.87 
 
 
311 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.56 
 
 
322 aa  250  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000493434  normal  0.801041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
317 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
317 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.83 
 
 
311 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
309 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.63 
 
 
312 aa  248  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
311 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.73 
 
 
319 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
313 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
314 aa  244  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
329 aa  244  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.09 
 
 
312 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.13 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  44.44 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 
311 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
322 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 
336 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.43 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
324 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.42 
 
 
315 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.44 
 
 
330 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 
313 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
340 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
340 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 
319 aa  241  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 
326 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 
514 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
343 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
329 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
310 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
360 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.45 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
365 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
313 aa  238  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43 
 
 
356 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.16 
 
 
321 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
322 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.44 
 
 
309 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.36 
 
 
318 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
312 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  43.27 
 
 
326 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.73 
 
 
316 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.82 
 
 
313 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
318 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
342 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  44.84 
 
 
340 aa  236  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.75 
 
 
318 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  44.84 
 
 
340 aa  236  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
318 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
340 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
347 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.85 
 
 
350 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
311 aa  235  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
318 aa  234  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.9 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.32 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
346 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 
326 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
330 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
333 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>