More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4269 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 317 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.03 
 
 		 317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.86 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 		 324 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 		 593 aa  269  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  43.41 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.18 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 		 408 aa  268  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.5 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.07 
 
 		 335 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.87 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.79 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.73 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 		 328 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.87 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.27 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  43.49 
 
 		 397 aa  255  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  43.28 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.11 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.55 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  41.27 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.11 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  43.2 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  40.79 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  42.47 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.07 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  40.96 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  42.14 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.17 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  41.27 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 		 342 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  41.57 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.17 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  42.69 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.27 
 
 		 373 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.94 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.29 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.9 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.79 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.29 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 		 335 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  38 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.82 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.86 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  41.27 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.61 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 		 345 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  41.64 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.99 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 		 335 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14357  predicted protein  40.84 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>