More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2923 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
352 aa  711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.24 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.32 
 
 
347 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.47 
 
 
343 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.43 
 
 
370 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
352 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  55.87 
 
 
346 aa  341  9e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
343 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 
379 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
376 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
384 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
370 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.98 
 
 
372 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 
370 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 
373 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
370 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.12 
 
 
372 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
382 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
369 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
373 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 
373 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
368 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.28 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
378 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
368 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  36.6 
 
 
368 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
377 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
368 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
364 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  33.52 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  32.66 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.66 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
375 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
354 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
373 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.56 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
309 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
327 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
321 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
325 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  29.19 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.15 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
309 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
312 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
306 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.38 
 
 
309 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  32.48 
 
 
320 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
316 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
302 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.05 
 
 
319 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
292 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
359 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
310 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
322 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
292 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
292 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
327 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  30.99 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
328 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
309 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
308 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
310 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
328 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
312 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>