More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2759 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
370 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.66 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.17 
 
 
373 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.9 
 
 
343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.43 
 
 
352 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  57.02 
 
 
346 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
343 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.29 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.45 
 
 
352 aa  282  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
372 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
376 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  37.57 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 
370 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
382 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.98 
 
 
370 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
373 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
370 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 
372 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.35 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
388 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.94 
 
 
372 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.95 
 
 
391 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
372 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  38.4 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
377 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
368 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
364 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
375 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
378 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
328 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
358 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.17 
 
 
298 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
327 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  33.62 
 
 
363 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
356 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
363 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
356 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  32.76 
 
 
363 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
356 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
364 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.76 
 
 
356 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
309 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
292 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
321 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
309 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 
328 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
309 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
306 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
314 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
313 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
309 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
312 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.59 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
313 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
311 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
310 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
308 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.71 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  32.64 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
287 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
310 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>