More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4414 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
334 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
321 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
338 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
323 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 
321 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 
321 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 
321 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 
321 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 
321 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
321 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  34.14 
 
 
321 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  36.28 
 
 
318 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
320 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  37.45 
 
 
324 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
318 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
317 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
293 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
349 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  25.69 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.65 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  24.62 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
321 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.55 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  28.01 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  32.19 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104829  normal  0.0341268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
320 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
315 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  32.75 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  26.91 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.89 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  26.91 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  26.91 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  30.84 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.39 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  28.51 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  33.76 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  30.62 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  30.9 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  31.49 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  30.37 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.36 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  31.91 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.56 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  26.84 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.215962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  24.53 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4699  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.65 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  26.86 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>