More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3093 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.7 
 
 		 349 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 350 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.48 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.13 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  61.29 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.65 
 
 		 349 aa  427  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.59 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.22 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  57.48 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.96 
 
 		 338 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.78 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.18 
 
 		 342 aa  349  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.57 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.75 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.21 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 347 aa  341  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 342 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 		 351 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  47.51 
 
 		 351 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.2 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.33 
 
 		 724 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  38.07 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.07 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 		 322 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.88 
 
 		 510 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.97 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  32.86 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.94 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  32.48 
 
 		 312 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  31.21 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  34.04 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  31.38 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  31.09 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  30.52 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  28.39 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  26.43 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.77 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  31.23 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  26.13 
 
 		 338 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  29.15 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  25.99 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  28.83 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  25.83 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  31.02 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  30.83 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  31.01 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.1 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  29.1 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  30.91 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  25.69 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  26.11 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  26.11 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  25.69 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 		 338 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  26.11 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  31.29 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  29.64 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  26.47 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 326 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>