More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0873 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
319 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
309 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
310 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  35.42 
 
 
312 aa  178  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  35.07 
 
 
313 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
310 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
310 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
312 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
510 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
328 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
501 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
330 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.01 
 
 
724 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
346 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
325 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
312 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
321 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
352 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
346 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.19 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
327 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
315 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.39 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
349 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
342 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
338 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
328 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  30.13 
 
 
353 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
312 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
351 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
342 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
348 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
353 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
325 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.4 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.67 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
353 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  27.95 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  32.56 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
316 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.06 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.52 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
677 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  29.8 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
308 aa  89.4  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0156  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  31.03 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
373 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.65 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  29.47 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.58 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  28.1 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.1 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.66 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.55 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.39 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>