More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0570 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
353 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.45 
 
 
342 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.05 
 
 
342 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.8 
 
 
342 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  65.2 
 
 
342 aa  484  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.31 
 
 
347 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.54 
 
 
350 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.17 
 
 
342 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.41 
 
 
352 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  55.88 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.59 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.29 
 
 
351 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 
350 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
349 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.91 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.11 
 
 
336 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 
349 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.48 
 
 
346 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  43.95 
 
 
353 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.4 
 
 
340 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.16 
 
 
347 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.95 
 
 
353 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  41.12 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  37.05 
 
 
346 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.05 
 
 
344 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
510 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
501 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
342 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
368 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  35.04 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
459 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.97 
 
 
724 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
312 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  31.92 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
312 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
312 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.65 
 
 
315 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.84 
 
 
337 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
325 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
310 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
309 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
319 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  26.9 
 
 
313 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  26.58 
 
 
312 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.18 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  30.25 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  28.73 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  27.56 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.9 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
326 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  29.76 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  27.53 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  28.62 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.2 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  25.64 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  29.08 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  26.57 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  26.54 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>