More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2126 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
301 aa  604  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.18 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.9 
 
 
301 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.33 
 
 
305 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2567  putative sulfolipid biosynthesis protein  47.39 
 
 
271 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 
271 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1956  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
271 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.606516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  29.87 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  31.66 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.85 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.97 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  36.48 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
677 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  30.1 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  32.95 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.39 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  27.97 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  23.56 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  27.71 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  29.73 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  28.11 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.71 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.47 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  30.12 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  27.31 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  26.98 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.43 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  28.92 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.31 
 
 
724 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  26.75 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  28.83 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  27.31 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  27.31 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  26.91 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  23.57 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  30.57 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.82 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.82 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  28.23 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  33.72 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>