More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02802 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  96.38 
 
 
304 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  96.38 
 
 
304 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  95.39 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  51.64 
 
 
303 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
304 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
318 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
328 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.19 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
327 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  33.44 
 
 
306 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
331 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
330 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.96 
 
 
330 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
331 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
333 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
294 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
411 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
316 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
352 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  26.93 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
358 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  30.53 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  31.33 
 
 
326 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.71 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2985  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.53 
 
 
319 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3363  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.53 
 
 
319 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2107  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.53 
 
 
319 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.53 
 
 
319 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1958  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
880 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0262576  hitchhiker  0.00141398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0455  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.53 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  25.81 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.83 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  30.88 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  28.25 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.05 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  25.61 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  25.18 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.58 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.12 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.84 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3315  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  31.27 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391729  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  25.08 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
328 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.24 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  27.52 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  27.52 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  26.98 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.01 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.01 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.57 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  30.19 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>