More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0447 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  651    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
331 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
331 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  32.25 
 
 
330 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  32.05 
 
 
330 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
336 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
331 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
335 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
411 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.18 
 
 
304 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
318 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
303 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.08 
 
 
304 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
304 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  25.42 
 
 
304 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
304 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.41 
 
 
304 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  27.7 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  27.5 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  27.96 
 
 
318 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  29.62 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  27.01 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  28.52 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  28.52 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
321 aa  89  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
326 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.25 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
327 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  27.8 
 
 
328 aa  87  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
309 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
304 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  27.45 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  27.41 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.71 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.65 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  25.29 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.39 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.39 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.39 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.39 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.97 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  28.39 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  31.75 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.46 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  27.68 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  27.5 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.97 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.3 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.62 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.28 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.46 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.91 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>