More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3215 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
304 aa  613  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.28 
 
 
297 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  43.32 
 
 
307 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  43.32 
 
 
307 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.21 
 
 
321 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  43.85 
 
 
304 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
307 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  43.18 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  41.42 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  42.07 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  37.17 
 
 
301 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.84 
 
 
301 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  45.57 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  36.84 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  36.84 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.84 
 
 
301 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  36.18 
 
 
301 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36.84 
 
 
301 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  37.54 
 
 
301 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.51 
 
 
301 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  36.51 
 
 
301 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  42.43 
 
 
297 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  43.41 
 
 
314 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  43.61 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  39.27 
 
 
302 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  41.35 
 
 
373 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  40.66 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  43.42 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  40.4 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  43.05 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  38.96 
 
 
307 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  40 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  40 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  42.35 
 
 
310 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  40.91 
 
 
301 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  38.49 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  44.22 
 
 
303 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.67 
 
 
297 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  40.26 
 
 
298 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.67 
 
 
297 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  40.59 
 
 
301 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.02 
 
 
297 aa  215  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  40.92 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  40.07 
 
 
298 aa  212  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  39.16 
 
 
297 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  40.07 
 
 
298 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  39.67 
 
 
297 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  39.47 
 
 
302 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.1 
 
 
313 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  39.34 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  39.34 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  39.34 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  41.38 
 
 
298 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  42.72 
 
 
298 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  38.11 
 
 
297 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.76 
 
 
302 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.76 
 
 
302 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.76 
 
 
302 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  36.45 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  41.5 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  36.45 
 
 
312 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  36.33 
 
 
312 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  39.07 
 
 
298 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
299 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  35.43 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  39.67 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  39.41 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  37.18 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  36.81 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
301 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  35.69 
 
 
309 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  40.78 
 
 
302 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  39.39 
 
 
294 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  37.75 
 
 
297 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  37.42 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  37.79 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  37.42 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  37.42 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  37.05 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  40.95 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  40.4 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  39.86 
 
 
305 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0810  hypothetical protein  34.98 
 
 
300 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0794  hypothetical protein  34.98 
 
 
300 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  33.55 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  39.09 
 
 
305 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  35.69 
 
 
309 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  38.61 
 
 
300 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  34.98 
 
 
303 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  35.48 
 
 
304 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.95 
 
 
297 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  36.13 
 
 
313 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  38.82 
 
 
295 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  39.07 
 
 
296 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.74 
 
 
300 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  39.07 
 
 
296 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
301 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>