More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0389 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 
318 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
320 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  37.93 
 
 
318 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
589 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.42 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
332 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
340 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
349 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
360 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.15 
 
 
357 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
347 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
328 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
328 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
328 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.46 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
466 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
350 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
349 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
347 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
344 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.48 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
323 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.99 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  22.43 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
677 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  27.55 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  27.08 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.81 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.81 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.81 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.81 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
876 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  29.81 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.5 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
746 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.5 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.21 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  30.31 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.21 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>