More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3208 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.45 
 
 
305 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.61 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 
273 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1956  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.606516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2567  putative sulfolipid biosynthesis protein  41.18 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  30.97 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.11 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  27.67 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  32.28 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  31 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  29.34 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  32.54 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.2 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  28.09 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  30.43 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.54 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  30.49 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  28.48 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  31.95 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  28.81 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  30.22 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  29.38 
 
 
339 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  32.16 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  27.07 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  29.14 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
347 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.54 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  29.71 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.22 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.16 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.5 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.16 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.16 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.16 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.49 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  27.43 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  27.92 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  30.91 
 
 
337 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  30.42 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  27.35 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  33.7 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  26.45 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  24.9 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  30.53 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>