More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6834 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.73 
 
 
277 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  35.99 
 
 
279 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
276 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.5 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  26.24 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  32.43 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  32.43 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  28.2 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  32.64 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  27.55 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  32.76 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.07 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
377 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.32 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  31.94 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1958  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
880 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0262576  hitchhiker  0.00141398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  32.76 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  26.4 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.69 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.444146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.94 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  32.71 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  30.66 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  32.34 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  30.69 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  34.2 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  28.34 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.46 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.75 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.46 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  26.43 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.52 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.33 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.89 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  27.62 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  26.49 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  26.18 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>