More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1317 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.98 
 
 
297 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.56 
 
 
297 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  73.13 
 
 
299 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.65 
 
 
301 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.3 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.53 
 
 
298 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  70.17 
 
 
297 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.58 
 
 
299 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
305 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
282 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.37 
 
 
292 aa  201  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
295 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
290 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
292 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  32.69 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
302 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
315 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
296 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.94 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
321 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
322 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  27.78 
 
 
280 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
327 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
315 aa  102  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.56 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  32.64 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  29.74 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  30.33 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  32.45 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  26.52 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0710  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.6 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.27 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.27 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  28.44 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  28.44 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.32 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  25.78 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  30.93 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  31.28 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  27.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>