More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1610 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
299 aa  620  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  78.16 
 
 
297 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.13 
 
 
297 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.45 
 
 
297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.4 
 
 
298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.41 
 
 
297 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.1 
 
 
301 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.32 
 
 
302 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 
296 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 
305 aa  291  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
282 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.66 
 
 
279 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
295 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.28 
 
 
292 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
296 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
290 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
300 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
302 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  31.49 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
309 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
321 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
322 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  31.6 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
279 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
327 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  25.51 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  30.45 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
560 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  26.77 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  27.57 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  28.11 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  26.83 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  25.4 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  26.49 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  28.11 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  27.86 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.32 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  26.88 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>