More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2126 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
325 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.64 
 
 
323 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.83 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 
327 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.09 
 
 
327 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  41.58 
 
 
364 aa  225  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.22 
 
 
343 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.06 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
297 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
297 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
273 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4287  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.42 
 
 
297 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
289 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.950966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  34.34 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  29.19 
 
 
342 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  25.73 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  25.73 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  31.89 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  30.34 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  34.8 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.9 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  31.46 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  32.95 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.16 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  31.35 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  29.78 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  32.34 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  30.81 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  30.81 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  30.27 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  29.19 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  24.85 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  30.34 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  28.65 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  28.19 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  32.3 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  32.16 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  26.5 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  30.34 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.67 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.95 
 
 
508 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  32.12 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  32.12 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  30.11 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  28.65 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  27.42 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  31.82 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  28.17 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  28.65 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  28.19 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  29.37 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  28.65 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  23.92 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  32.02 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  28.65 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>