More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3538 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.02 
 
 
297 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.83 
 
 
289 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.950966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.68 
 
 
273 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4287  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.85 
 
 
297 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 
334 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  34.62 
 
 
364 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
327 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
325 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
326 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.08 
 
 
323 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.64 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.11 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  38.51 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.96 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.88 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.88 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  34.08 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  34.08 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  31.52 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  36.13 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  29.49 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  31.51 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  31.51 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.84 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.84 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  31.51 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  26.7 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.89 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.32 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  36.03 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.37 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
501 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
677 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  35.26 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.97 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  25.5 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.68 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.68 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.68 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>