More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7825 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 
314 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 
311 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
322 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.7 
 
 
285 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
316 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  38.14 
 
 
241 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
311 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  32.43 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  28.04 
 
 
336 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.46 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.54 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.34 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  25 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  30.65 
 
 
353 aa  62.4  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  30.24 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.44 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  24.05 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  30.48 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  23.05 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  30.65 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  22.65 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  33.08 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.5 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
250 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
291 aa  59.3  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  28.05 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.18 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  31.56 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  24.75 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>