More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0264 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
314 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
311 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.06 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.97 
 
 
317 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
322 aa  281  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.2 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.48 
 
 
312 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.48 
 
 
312 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.67 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.58 
 
 
310 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
287 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
302 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
311 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  37.19 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
317 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
245 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
316 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
241 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.25 
 
 
249 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
193 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
245 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
310 aa  99  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  34.07 
 
 
241 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.2 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.99 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  22.83 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.34 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  22.51 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  25.54 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  28.71 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.59 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.39 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  18.77 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.08 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
279 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.89 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
340 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1063  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  23.22 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.46 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.06 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.36 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.36 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>