More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4457 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.62 
 
 
295 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.56 
 
 
312 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  38.85 
 
 
300 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
298 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
319 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 
287 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
293 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
303 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  32.66 
 
 
297 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
297 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
291 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
291 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
292 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  33.78 
 
 
303 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
296 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
298 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
294 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  31.71 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  29.95 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
293 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.96 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
328 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  30.4 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.99 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.99 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  30.6 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.53 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.72 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  27.3 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.78 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  32.93 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  27.3 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  24.52 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  24.76 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  39.02 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  24.36 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  30.74 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  23.87 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  24.07 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.4 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.84 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  24.84 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  24.84 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  23.72 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  23.72 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  23.72 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  23.72 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  23.72 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>