More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1649 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.42 
 
 
294 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.05 
 
 
307 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.29 
 
 
298 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.45 
 
 
297 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  58.11 
 
 
297 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.02 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.02 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.02 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.73 
 
 
296 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  56.76 
 
 
297 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  56.76 
 
 
297 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 
296 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
295 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 
297 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.09 
 
 
297 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.58 
 
 
293 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.73 
 
 
296 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.63 
 
 
297 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 
296 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
294 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.68 
 
 
299 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.59 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  54.39 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.23 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.6 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  53.56 
 
 
295 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.56 
 
 
297 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.89 
 
 
292 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.82 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
295 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.99 
 
 
302 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
328 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.85 
 
 
301 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.37 
 
 
323 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.04 
 
 
293 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.59 
 
 
295 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.18 
 
 
321 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.81 
 
 
311 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  42.23 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
321 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
323 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 
289 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  42.32 
 
 
301 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 
294 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  35.55 
 
 
316 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  33.44 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
301 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.65 
 
 
310 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
291 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
303 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
303 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
319 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
297 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.58 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  30.64 
 
 
619 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  51.43 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.01 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  35.86 
 
 
512 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  39.06 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 
326 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.27 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  34.23 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>