More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4244 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
287 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
291 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
286 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  36.36 
 
 
300 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.23 
 
 
295 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
298 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
293 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
321 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
294 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  31.79 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  29.29 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
303 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
303 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  28.28 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.89 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.89 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
295 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  30.52 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.1 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.32 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  31.58 
 
 
619 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  27.04 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.71 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  27.62 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09152  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 
360 aa  62.4  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02090  expressed protein  25.96 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  21.89 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.67 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  22.85 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
680 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.22 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.91 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>