More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2159 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  67.97 
 
 
619 aa  340  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3092  NmrA-like protein  39.72 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08611  hypothetical protein  32.14 
 
 
299 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0698127  hitchhiker  0.000145998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0729  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  28.95 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
294 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
308 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
296 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  25.93 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.95 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14261  hypothetical protein  23.53 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0547193  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  27.37 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  26.45 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  25 
 
 
320 aa  89  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1479  hypothetical protein  36 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.1879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
324 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  24.24 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  22.97 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.42 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  27.69 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  24.04 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.37 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  27.92 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0169  putative transmembrane oxidoreductase protein  23.38 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.83 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  28.47 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31.86 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  23.81 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.53 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  25.93 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.53 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.19 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.58 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.53 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.53 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.68 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.18 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.1 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  22.08 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.03 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  22.51 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.5 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.96 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.58 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.91 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
746 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.76 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.04 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.06 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>