More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2758 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.02 
 
 
309 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.02 
 
 
309 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.35 
 
 
310 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  73.63 
 
 
313 aa  501  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.29 
 
 
310 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  58.71 
 
 
313 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  48.85 
 
 
301 aa  294  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  49.13 
 
 
306 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  46.43 
 
 
341 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  47.1 
 
 
306 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  48.52 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  48.52 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  44.44 
 
 
361 aa  281  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  44.84 
 
 
306 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  44.52 
 
 
306 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  45.07 
 
 
306 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  44.48 
 
 
323 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  36.05 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  36.05 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  32.7 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
328 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
342 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
338 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
352 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  26.61 
 
 
341 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
315 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  27.31 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  26.61 
 
 
341 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.61 
 
 
329 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  25.81 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  26.21 
 
 
345 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  25.82 
 
 
345 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.7 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.79 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  24.86 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  25.41 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.39 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  25.61 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  24.86 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.56 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  23.76 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  25.32 
 
 
619 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  25.41 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.75 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.41 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  24.31 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  26.07 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  25.41 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  25.41 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.15 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>