More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1289 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.86 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.77 
 
 
298 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  62.33 
 
 
297 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.78 
 
 
295 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.12 
 
 
295 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  61.99 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  61.99 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.8 
 
 
301 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.08 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.3 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.96 
 
 
297 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.67 
 
 
295 aa  298  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.04 
 
 
294 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.51 
 
 
293 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.9 
 
 
297 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  58.9 
 
 
297 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.42 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  53.79 
 
 
303 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 
294 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.82 
 
 
294 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 
295 aa  268  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.98 
 
 
307 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
297 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
328 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 
292 aa  254  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 
294 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.52 
 
 
296 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.52 
 
 
296 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.52 
 
 
296 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
293 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.78 
 
 
299 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.31 
 
 
323 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
292 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.64 
 
 
298 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.51 
 
 
321 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 
297 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  47.1 
 
 
295 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  41.02 
 
 
297 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.53 
 
 
323 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.96 
 
 
293 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
321 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  39.26 
 
 
301 aa  192  8e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
311 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.36 
 
 
289 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  32.53 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
301 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.77 
 
 
310 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
319 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
299 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
298 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
307 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
286 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
297 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
297 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  31.65 
 
 
300 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
319 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  29.65 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.16 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.46 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  25.96 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  36.09 
 
 
329 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  25.37 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  25.26 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>