More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2220 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 
287 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  35.59 
 
 
300 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
286 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
293 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
293 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  33.77 
 
 
303 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
297 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
297 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
296 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
303 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
303 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
307 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
303 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
295 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
312 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
298 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
301 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
297 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
301 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
297 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  32 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.01 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  29.61 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
295 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  28.51 
 
 
351 aa  75.5  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.3 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  30.72 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  24.62 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08988  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956062  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09152  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
360 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.7 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02090  expressed protein  29.67 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  25.34 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  29.41 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
292 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.76 
 
 
332 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  33.83 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  26.51 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.36 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.8 
 
 
330 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  26.28 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  25.38 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  27.36 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>