More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5391 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
295 aa  577  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.44 
 
 
297 aa  362  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.56 
 
 
294 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.54 
 
 
294 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.54 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.2 
 
 
307 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  50 
 
 
303 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
293 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.99 
 
 
295 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  47.46 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
296 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.86 
 
 
297 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.14 
 
 
297 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  51.19 
 
 
297 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  51.19 
 
 
297 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
296 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
296 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
296 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.12 
 
 
296 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.78 
 
 
294 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.17 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
295 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.15 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 
293 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
295 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.82 
 
 
299 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
292 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 
292 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 
296 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
297 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  48.47 
 
 
297 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.93 
 
 
298 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 
302 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
298 aa  215  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  43.57 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
328 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 
323 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
295 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  202  6e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.17 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
294 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  40 
 
 
301 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 
293 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  34.77 
 
 
316 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.44 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
301 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
299 aa  92  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  34.31 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  40.52 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
329 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.95 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  37.31 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.43 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  28.74 
 
 
619 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  27.06 
 
 
351 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.16 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
355 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  37.84 
 
 
351 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>