More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0785 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.33 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.59 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.82 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.23 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.7 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.22 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.46 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  32.84 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.82 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.73 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 320 aa  99.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  32.17 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 331 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 334 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.34 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  31.83 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  32.47 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.93 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  31.06 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  31.55 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  30.03 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.52 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  31.48 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.19 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  30.25 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.36 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  29.91 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  29.52 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>