More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2719 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.86 
 
 		 302 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.45 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.59 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.91 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.94 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.31 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.92 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.44 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.8 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.29 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0710  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.39 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 329 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.84 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  32.45 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 370 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.23 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>