More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0359 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
325 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.69 
 
 
325 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.99 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
321 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291961  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
302 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 
302 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
297 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 
300 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
322 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
324 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
336 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
335 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
335 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
334 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.95 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  28.01 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.06 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
335 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
335 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  27.94 
 
 
337 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
336 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  29.01 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.44 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.67 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.32 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.32 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  29.48 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03951  putative nucleotide sugar epimerase  29.8 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.658541  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1681  putative nucleotide sugar epimerase  29.8 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.174267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.15 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  32.34 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.62 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  27.99 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.91 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0450  WbnF  26.72 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  26.56 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  27.41 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  26.1 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>