More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1021 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 324 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.74 
 
 		 322 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 300 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.2 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  30 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.21 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.87 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 333 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8500  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  29.5 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 343 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0450  WbnF  24.22 
 
 		 355 aa  95.9  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  27.22 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  30.37 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  28.96 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  31.38 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.88 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.53 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 593 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 310 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  25.93 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  24.54 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>