More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4367 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.2 
 
 
331 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.2 
 
 
331 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.29 
 
 
333 aa  474  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  68.4 
 
 
318 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  69.68 
 
 
315 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  56.91 
 
 
348 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
314 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
312 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
315 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.49 
 
 
316 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.53 
 
 
315 aa  323  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
321 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.79 
 
 
319 aa  316  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.46 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  49.21 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  49.84 
 
 
321 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 
321 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 
322 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  49.52 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  49.52 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  49.52 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  49.52 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  49.52 
 
 
321 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  49.2 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  45.14 
 
 
378 aa  296  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  45.48 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
321 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
321 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  43.23 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.87 
 
 
316 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  50.89 
 
 
224 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
327 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
327 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
357 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  28.15 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.87 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.87 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.87 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.87 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3119  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.87 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0293341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
326 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
326 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.85 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.15 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  24.14 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  24.32 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.01 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.47 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.9 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  25.9 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  25.9 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.9 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  25.9 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49188  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  28.76 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.765579  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.21 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  25.67 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  25.81 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.51 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00850  conserved expressed protein  23.87 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>