More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0444 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  99.69 
 
 
323 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  99.69 
 
 
323 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  99.69 
 
 
323 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.38 
 
 
323 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  91.33 
 
 
323 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.66 
 
 
323 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.66 
 
 
323 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.35 
 
 
323 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.66 
 
 
323 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.35 
 
 
323 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.42 
 
 
323 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.73 
 
 
323 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  78.26 
 
 
326 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.02 
 
 
326 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.32 
 
 
329 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.78 
 
 
326 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.85 
 
 
326 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.44 
 
 
323 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  66.25 
 
 
324 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.35 
 
 
332 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.35 
 
 
332 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  55.03 
 
 
332 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.45 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.45 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  51.41 
 
 
321 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  51.41 
 
 
321 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
329 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.02 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.93 
 
 
316 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.93 
 
 
316 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.62 
 
 
316 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.62 
 
 
316 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3119  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.93 
 
 
316 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0293341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  47.52 
 
 
315 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.07 
 
 
342 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.765579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.32 
 
 
327 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.09 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.09 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.92 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.99 
 
 
325 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.17 
 
 
348 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
356 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49188  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 
325 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.09 
 
 
341 aa  275  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.58 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.415706  decreased coverage  0.000106106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.54 
 
 
339 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  271  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.4 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 
327 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0866778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.55 
 
 
328 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.611335  normal  0.301343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.99 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3557  putative UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 
330 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.03 
 
 
328 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.459249  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 
314 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03119  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12770)  43.87 
 
 
316 aa  250  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00746  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14210)  42.55 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761224  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.8 
 
 
339 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000498566  decreased coverage  0.0000954183 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08100  conserved hypothetical protein  40.12 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00850  conserved expressed protein  35.76 
 
 
359 aa  186  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3206  hypothetical protein  37.62 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  38.56 
 
 
318 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
311 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  35.43 
 
 
635 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.28 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2397  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 
306 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1940  hypothetical protein  36.05 
 
 
308 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5494  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.99 
 
 
306 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  25.91 
 
 
378 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  34.95 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  25.89 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  33.49 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  25.9 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  27.34 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  31.47 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  26.16 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  26.16 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  29.74 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  24.41 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  25.83 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  25.83 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  25.83 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>