222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0588 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  99.54 
 
 
321 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  99.54 
 
 
321 aa  461  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  99.54 
 
 
321 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  99.09 
 
 
321 aa  460  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  99.09 
 
 
321 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  99.09 
 
 
321 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  98.63 
 
 
321 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.72 
 
 
321 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.69 
 
 
321 aa  431  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  74.65 
 
 
378 aa  347  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.69 
 
 
316 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  70.18 
 
 
318 aa  333  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
321 aa  313  9e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
321 aa  313  9e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.67 
 
 
325 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.64 
 
 
319 aa  302  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  63.06 
 
 
318 aa  296  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.09 
 
 
314 aa  260  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.59 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.82 
 
 
315 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  51.13 
 
 
318 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  50.89 
 
 
324 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 
331 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 
331 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  49.32 
 
 
315 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.23 
 
 
333 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  49.77 
 
 
348 aa  230  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
312 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.88 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 
316 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
320 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
357 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.3 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  24.3 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.48 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  24.87 
 
 
326 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
323 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
323 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 
323 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
327 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 
323 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
326 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.94 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 
323 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
330 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.56 
 
 
316 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 
329 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
351 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
337 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
339 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  24.6 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.6 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  25.42 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  24.6 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  24.6 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
348 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.6 
 
 
323 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
326 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.06 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
335 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 
342 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.765579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  27.34 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.42 
 
 
336 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.28 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
328 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
326 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 
343 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  24.4 
 
 
635 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.4 
 
 
315 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  23.44 
 
 
321 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
309 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
346 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  23.44 
 
 
321 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
337 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.15 
 
 
316 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
335 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
373 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.15 
 
 
316 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.54 
 
 
334 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29920  NAD-dependent epimerase protein  25.35 
 
 
367 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
335 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
357 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.15 
 
 
316 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.15 
 
 
316 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
318 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>