More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2958 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
325 aa  667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.21 
 
 
319 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  59.62 
 
 
378 aa  418  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  57.05 
 
 
321 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  56.74 
 
 
321 aa  401  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  56.74 
 
 
321 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
321 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  56.74 
 
 
321 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  56.74 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  57.74 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.74 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  56.74 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  56.43 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  55.06 
 
 
318 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 
316 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
315 aa  359  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.89 
 
 
321 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.89 
 
 
321 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  51.12 
 
 
318 aa  345  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.55 
 
 
314 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
312 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  53.67 
 
 
318 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  51.13 
 
 
348 aa  320  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  53.53 
 
 
315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  51.46 
 
 
324 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  62.67 
 
 
224 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.28 
 
 
316 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.95 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
323 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
332 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.08 
 
 
332 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  27.08 
 
 
332 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
329 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
323 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  31.56 
 
 
326 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
326 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
323 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
327 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
327 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.47 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
319 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  32.51 
 
 
323 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  32.1 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.1 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.1 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  32.1 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  32.1 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.69 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  27.3 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  27.3 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  24.68 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.94 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3119  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.55 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0293341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.55 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.55 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.55 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.55 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3557  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.87 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  32.94 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  32.94 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  46.99 
 
 
91 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  32.93 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  34.62 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.79 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  28.03 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.22 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>