67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0587 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  100 
 
 
91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
321 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  98.81 
 
 
321 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  97.62 
 
 
321 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  94.05 
 
 
321 aa  157  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  66.67 
 
 
378 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.65 
 
 
321 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.65 
 
 
321 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  57.65 
 
 
318 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  56.63 
 
 
348 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
316 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.78 
 
 
312 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.38 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
319 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  49.41 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
315 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.78 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.99 
 
 
325 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.91 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
322 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  43.37 
 
 
324 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  45.12 
 
 
315 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 
333 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  41.38 
 
 
318 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
331 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
331 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
326 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  31.76 
 
 
324 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
324 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
304 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.14 
 
 
350 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
330 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  32.53 
 
 
688 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 
323 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  31.17 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 
323 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  33.78 
 
 
328 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  32.29 
 
 
336 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 
328 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  39.24 
 
 
330 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
331 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
313 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  34.52 
 
 
332 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
340 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  35.29 
 
 
341 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
330 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
330 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
330 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  32.22 
 
 
327 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  31.71 
 
 
339 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  32.18 
 
 
330 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  31.71 
 
 
339 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
342 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 
328 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  33.78 
 
 
328 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  36.14 
 
 
355 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
322 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>