More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2894 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 339 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  65.57 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  58.16 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  57.65 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 337 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  50.91 
 
 		 340 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 339 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 340 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 337 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  49.09 
 
 		 340 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 340 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 340 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 336 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  49.24 
 
 		 339 aa  334  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  48.5 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 337 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  45.51 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  47.89 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  47.92 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  325  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  46.08 
 
 		 342 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 340 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  46.99 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 338 aa  321  9.000000000000001e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 352 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  45.78 
 
 		 338 aa  318  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  43.71 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  48.48 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>