More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2838 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 340 aa  701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  54.9 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  51.19 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  51.79 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  55.05 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  54.38 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  53.61 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  52.71 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  53.61 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  52.89 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  53.15 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  53.33 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  53.92 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  54.38 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  53.45 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  54.55 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  51.93 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  54.6 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  52.11 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  54.24 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  52.23 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  52.23 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  55.32 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  52.23 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  52.41 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  52.41 
 
 		 337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  52.73 
 
 		 338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  51.93 
 
 		 338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 338 aa  361  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  51.34 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  51.05 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  51.66 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  53.64 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  51.93 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  52.71 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  52.11 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 340 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 340 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  51.63 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 337 aa  358  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  50.9 
 
 		 335 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  51.66 
 
 		 339 aa  358  8e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  52.71 
 
 		 335 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  53.47 
 
 		 336 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 338 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  51.48 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  53.64 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  53.03 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  53.03 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  51.36 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  53.01 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  52.87 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  51.5 
 
 		 339 aa  355  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 		 337 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  52.76 
 
 		 336 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  50.75 
 
 		 339 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  53.03 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  51.18 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  51.51 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  51.35 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>