More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0495 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 336 aa  692    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  57.8 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  57.67 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  54.82 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  56.4 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  57.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  55.15 
 
 		 339 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  55.79 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  56.13 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  55.79 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  55.32 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  54.88 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  53.37 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  53.96 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  54.14 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  53.07 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  54.27 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  54.85 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  53.66 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  53.94 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  55.32 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  53.05 
 
 		 341 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  54.6 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  51.51 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  52.44 
 
 		 335 aa  359  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  52.29 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  53.96 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  54.29 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  54.15 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 341 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 341 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  52.42 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  52.76 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 337 aa  355  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 338 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 339 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  52.28 
 
 		 338 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  52.13 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  51.07 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  52.28 
 
 		 342 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  51.82 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 366 aa  351  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  53.19 
 
 		 349 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>