More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0468 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  97.34 
 
 		 338 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 338 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  61.4 
 
 		 340 aa  428  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  62.12 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  60.24 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  61.01 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  61.52 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  61.21 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  60.3 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  60.3 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  62.42 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  61.21 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  61.21 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  60.91 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  60.91 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  60.61 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  60.61 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  58.88 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  57.58 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  60.61 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  59.17 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  56.68 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  60.49 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  59.21 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  58.93 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  58.58 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  58.58 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  58.58 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  57.99 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  58.48 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  58.86 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  58.97 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  54.9 
 
 		 337 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  57.88 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  56.36 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  58.66 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  58.48 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  57.58 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  58.79 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  56.4 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  58.66 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  58.66 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  55.49 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  56.51 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  56.5 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  55.62 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  55.15 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  57.01 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  57.69 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3079  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  57.75 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 		 340 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  55.76 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  55.45 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  54.85 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  55.45 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  57.83 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  55.45 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  57.27 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  55.76 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  54.24 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  54.55 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  54.55 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  57.44 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  53.64 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  54.01 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  54.55 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  54.55 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>