More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0182 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 342 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  54.28 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  51.78 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 338 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 339 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  49.11 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 340 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  48.19 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  48.94 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 339 aa  315  9e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  48.35 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  47.45 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  48.04 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  47.45 
 
 		 337 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  48.5 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  46.92 
 
 		 351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3082  UDP-glucose 4-epimerase  47.16 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  46.25 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 336 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  45.05 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  45.05 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 342 aa  301  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  46.55 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  44.78 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  44.14 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.16 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  45.32 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  47.01 
 
 		 336 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  46.55 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  44.74 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  45.32 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27190  predicted protein  43.77 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  45.67 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  44.64 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>