More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3613 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 340 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  59.47 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  60.24 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 339 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  48.8 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  49.12 
 
 		 351 aa  337  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.5 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 340 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  47.73 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  47.73 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  48.98 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  48.81 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  48.8 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  47.43 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 339 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  47.45 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 338 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  45.18 
 
 		 342 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  47.73 
 
 		 340 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  45.56 
 
 		 339 aa  322  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  48.66 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  47.73 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  48.82 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  46.09 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3079  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  46.15 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  47.13 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  48.25 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  48.67 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  48.36 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  45.88 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  47.76 
 
 		 334 aa  315  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  46.2 
 
 		 377 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  46.41 
 
 		 339 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  45.78 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  45.48 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  46.22 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  48.64 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  47.43 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>