More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1892 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 377 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  68.06 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  58.26 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  58.88 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  56.05 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  58.54 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  61.59 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  57.91 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  56.68 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  56.68 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  57.19 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  55.82 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  55.82 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  55.82 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  55.65 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  55.65 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  55.26 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  55.99 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  54.95 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  55.65 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  59.33 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 		 340 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  56.16 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  53.37 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  54.36 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  57.86 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  53.85 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  56.16 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  58.08 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  53.71 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  54.17 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  55.22 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  54.49 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  54.19 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  55.46 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  53.45 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  58.59 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  54.19 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  54.49 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  53.57 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  54.95 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  55.26 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  53.45 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  54.95 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  52.85 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>