More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1753 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 339 aa  690    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  55.22 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  53.13 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  54.14 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  52.84 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  51.04 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  53.59 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  51.18 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  51.04 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  52.68 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  54.88 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  51.94 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  52.54 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  52.38 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  53.13 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  52.38 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  52.07 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  52.38 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  52.38 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  52.24 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  52.08 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  54.27 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 341 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 341 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  52.54 
 
 		 340 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  52.54 
 
 		 340 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  53.55 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  51.5 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  51.34 
 
 		 337 aa  361  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 340 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  54.49 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 336 aa  358  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  54.49 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  54.49 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  53.37 
 
 		 335 aa  358  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 340 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  52.54 
 
 		 339 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  51.49 
 
 		 338 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  52.24 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  51.5 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  51.92 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  52.1 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  52.74 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  52.69 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  52.1 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 337 aa  352  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  49 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  50.59 
 
 		 343 aa  351  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  49.71 
 
 		 353 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 337 aa  350  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  52.1 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  51.8 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  51.33 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  50.6 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  51.8 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  52.54 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  52.54 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>